Le Theater an der Wien ouvre le 13 juin 1801 à l’initiative d’Emanuel Schikaneder, librettiste de « La Flûte enchantée ». Le bâtiment est généralement attribué à l’architecte Franz Jäger. Ludwig van Beethoven y travaille comme compositeur et chef ; « Fidelio » y est créé en 1805. Le théâtre accueille ensuite des œuvres de Nestroy et Raimund, puis plusieurs jalons de l’opérette viennoise.

Après la Seconde Guerre mondiale, le lieu sert pendant dix ans de scène principale à la Wiener Staatsoper. À partir des années 1960, il accueille les Wiener Festwochen puis développe une longue période consacrée aux comédies musicales, avec notamment les productions germanophones de « Cats » et la création d’« Elisabeth ». En 2006, il devient l’opéra de la Ville de Vienne exploité en système stagione.

Le théâtre dispose de 1 129 sièges et de 50 places debout. Une rénovation générale menée de mars 2022 à octobre 2024 modernise la scène, les équipements, l’accessibilité et les espaces de travail tout en conservant les éléments historiques. La réouverture officielle a lieu le 12 octobre 2024 ; les productions reviennent alors de la Halle E du MuseumsQuartier au bâtiment de la Linke Wienzeile.

Stefan Herheim dirige l’institution depuis la saison 2022-2023 et adopte la forme programmatique MusikTheater an der Wien. La maison ne possède pas d’orchestre permanent : elle travaille régulièrement avec le Wiener Symphoniker, l’ORF Radio-Symphonieorchester Wien, le Klangforum Wien, le Concentus Musicus Wien et l’Arnold Schoenberg Chor. Sa programmation couvre quatre siècles d’opéra, d’opérette, de formes concertantes et de création, avec des ateliers et spectacles pour les jeunes publics.